Online konvertor OIF do PNG zdarma

Co je formát OIF

OIF znamená Olympus Image Format a používá se pro microscopy data pořízená pomocí systémů Olympus FluoView a souvisejících confocal imaging systems. Olympus acquisition software může ukládat obraz s metadata popisujícími kanály, z-sections, time points, velikost pixelu a nastavení mikroskopu. OIF dataset může obsahovat doprovodné datové soubory nebo související binární soubor OIB, proto uchovávejte kompletní původní dataset pohromadě a nekopírujte pouze viditelný soubor .oif.

OIF se běžně vyskytuje v laboratořích, microscopy archives a image-analysis workflows. Obecné prohlížeče jej nemusí rozpoznat, ale Fiji/ImageJ s Bio-Formats Importer jej obvykle dokáže načíst.

Co je formát PNG

PNG je lossless raster image format podporovaný webovými prohlížeči, kancelářským softwarem, grafickými editory a vědeckými aplikacemi. Zachovává hodnoty pixelů bez kompresních artefaktů typických pro JPEG a podporuje průhlednost a, pokud to software umožňuje, také 16-bit grayscale data.

PNG je vhodné pro single channel, z-slice, time point nebo rendered composite určený k prohlížení, anotaci, publikování nebo sdílení. Není náhradou za původní OIF dataset, pokud musí zůstat dostupná microscope metadata, multiple channels, z-stacks, time series nebo quantitative calibration.

Jak převést OIF na PNG

Pomocí Fiji/ImageJ a Bio-Formats

1. Nainstalujte Fiji, které běžně obsahuje Bio-Formats Importer.
2. Otevřete dataset pomocí File → Open a vyberte soubor .oif. Pokud dataset obsahuje doprovodné soubory, ponechte je v původní složce.
3. V okně Bio-Formats Import Options vyberte požadovanou sérii. Pokud potřebujete prohlížet z-sections, channels nebo time points, aktivujte View stack with nebo ekvivalentní stack option.
4. Vyberte channel, slice a time point, které chcete exportovat. U composite image před uložením upravte barvy a viditelnost channelů.
5. Exportujte zobrazenou rovinu pomocí File → Save As → PNG a poté zvolte filename, například sample_c1_z05.png.
6. Chcete-li exportovat každou rovinu jako samostatný soubor PNG, použijte File → Save As → Image Sequence a vyberte PNG. Ověřte, že output naming scheme zaznamenává čísla channelů, slices nebo time points.

Pro rychlý převod bez instalace software nahrajte OIF dataset na 101convert.com, vyberte PNG a stáhněte výsledek. Tato možnost není vhodná pro důvěrná nebo regulovaná microscopy data, pokud zásady pro práci se soubory nepovolují jejich nahrávání.

Omezení kvality a kompatibility

PNG compression je lossless, export však může data přesto změnit. Fiji nebo jiný reader může převést 12-bit nebo 16-bit source na 8-bit, pokud je obraz zobrazen nebo převeden s tímto nastavením; pokud záleží na quantitative intensity values, před uložením zkontrolujte Image → Type. Vyhněte se contrast-stretching nebo použití lookup table, pokud je PNG určeno pouze k prezentaci.

PNG běžně obsahuje jeden rasterized view. OIF-specific metadata, microscope calibration, channel relationships, struktura z-stacku, informace o time-series a acquisition settings mohou být ztraceny. Uchovejte původní OIF/OIB dataset a PNG používejte jako derivative pro prohlížení nebo publikaci.