Online konvertor LIF do PNG zdarma

Co je formát LIF

LIF je formát Leica Image File, proprietární kontejner používaný mikroskopickými systémy Leica a softwarem, jako jsou Leica Application Suite, LAS X a pracovní postupy konfokálního zobrazování. Jeden soubor může obsahovat více obrazových sérií, kanály, z-snímky, časové body a metadata záznamu namísto jednoho běžného bitmapového obrázku.

Protože LIF je mikroskopický kontejner, obecné prohlížeče obrázků jej nemusí správně otevřít. Fiji/ImageJ s pluginem Bio-Formats je běžná desktopová možnost pro čtení dat LIF a výběr konkrétní série nebo roviny.

Co je formát PNG

PNG je bezeztrátový rastrový formát podporovaný webovými prohlížeči, kancelářským softwarem, editory obrázků a operačními systémy. Podporuje odstíny šedi, RGB, průhlednost RGBA a běžně používaná 8bitová nebo 16bitová kanálová data bez artefaktů komprese typických pro JPEG.

PNG je vhodný, když má být výstup samostatným obrázkem pro anotaci, prezentaci, pracovní verzi publikace nebo použití na webu. Nezachovává úplnou strukturu kontejneru LIF, metadata mikroskopu, více kanálů, z-stacky ani časové série v jednom běžném souboru PNG.

Jak skutečně převést LIF na PNG

Pomocí online převodníku

1. Otevřete převodník LIF na PNG na webu 101convert.com; lze jej používat zdarma bez instalace softwaru.
2. Nahrajte soubor .lif a spusťte převod.
3. Pokud soubor obsahuje několik sérií nebo rozměrů, vyberte požadovaný obrázek nebo možnost výstupu, jakmile ji převodník nabídne. Víceobrázkový soubor LIF může vytvořit několik souborů PNG nebo archiv ke stažení.
4. Stáhněte výsledný soubor .png nebo archiv a otevřete jej v prohlížeči obrázků, abyste ověřili vybraný snímek, rozměry a barvy.

Pomocí Fiji a Bio-Formats

1. Nainstalujte Fiji, které obsahuje importér Bio-Formats, a poté otevřete soubor prostřednictvím Plugins → Bio-Formats → Bio-Formats Importer.
2. V dialogovém okně importu vyberte požadovanou sérii LIF. Možnosti jako Split channels nebo Open all series použijte pouze tehdy, když potřebujete samostatné obrázky kanálů nebo sérií.
3. Chcete-li uložit jednu zobrazenou rovinu, zvolte File → Save As → PNG a zadejte název souboru, například sample.png.
4. Chcete-li uložit každý řez nebo časový bod, zvolte File → Save As → Image Sequence, vyberte jako formát PNG a zvolte výstupní složku. Fiji zapíše jeden soubor PNG pro každou rovinu.

Kvalita, kompatibilita a omezení

PNG zachovává hodnoty pixelů, které byly exportovány, ale nemůže zachovat všechny informace ze zdrojového záznamu. Export složeného zobrazení RGB odstraní samostatně upravitelná data kanálů; export 8bitového obrázku také odstraní přesnost intenzity ze zdroje s 12bitovou, 16bitovou nebo plovoucí desetinnou přesností.

Pro kvantitativní mikroskopii si ponechte původní LIF a exportujte 16bitové obrázky PNG v odstínech šedi, pokud je přijímající software podporuje. Vyhněte se snímkům obrazovky, protože škálování zobrazení, překryvy a úpravy kontrastu mohou změnit zaznamenané hodnoty. Po převodu zkontrolujte rozměry obrázku a vzhled kanálů, zejména pokud LIF obsahuje více sérií nebo nestandardní mapování barev.