Online konvertor LIF do TIFF zdarma

Co je formát LIF

LIF, obvykle označovaný jako Leica Image File, je proprietární mikroskopický kontejner vytvořený softwarem Leica Microsystems, například Leica Application Suite a LAS X. Jeden soubor LIF může obsahovat více obrazových sérií se samostatnými kanály, z-stacks, časovými body, dlaždicovými skeny a metadaty mikroskopu.

Soubory LIF běžně vytvářejí fluorescenční, konfokální a widefield mikroskopické systémy Leica. V běžných aplikacích pro fotografie nebo dokumenty se nemusí otevřít správně, protože obrazová data mohou být vícerozměrná, nikoli pouze jeden plochý obrázek.

Co je formát TIFF

TIFF je široce podporovaný formát rastrových obrázků používaný v editorech obrázků, aplikacích pro desktop publishing, vědeckém softwaru a archivních pracovních postupech. Podporuje obrázky ve stupních šedi, RGB i vícekanálové obrázky a také 8-bitová, 16-bitová a některá 32-bitová obrazová data.

TIFF je vhodný, když potřebujete vysokou kvalitu obrazu a širokou kompatibilitu. Komprese LZW a ZIP jsou bezztrátové; nekomprimované soubory TIFF jsou větší, zatímco TIFF komprimovaný pomocí JPEG může zahodit informace a obecně není vhodný pro kvantitativní mikroskopii.

Jak převést LIF na TIFF

Pomocí Fiji s Bio-Formats

1. Nainstalujte Fiji, které obsahuje importér mikroskopických formátů Bio-Formats.
2. Otevřete Fiji a zvolte Plugins → Bio-Formats → Bio-Formats Importer.
3. Vyberte soubor .lif. Pokud obsahuje několik sérií, zvolte požadovanou sérii v dialogu pro výběr sérií.
4. Zachovejte původní bitovou hloubku. Možnosti jako View stack with nebo Open all series povolte pouze tehdy, když ve Fiji potřebujete stack nebo více sérií.
5. Pro běžný soubor TIFF zvolte File → Save As → Tiff a zadejte název výstupního souboru.
6. U vícerozměrné datové sady použijte, pokud je k dispozici, Plugins → Bio-Formats → Bio-Formats Exporter, poté vyberte TIFF nebo OME-TIFF a nakonfigurujte požadovanou kompresi a nastavení rozměrů.

Fiji může soubory LIF otevřít také prostřednictvím File → Open, pokud je registrován reader Bio-Formats, ale Bio-Formats Importer poskytuje větší kontrolu nad sériemi, kanály a stacky.

Pomocí online konvertoru

Soubor můžete zdarma převést na webu 101convert.com bez instalace softwaru. Nahrajte soubor LIF, jako výstupní formát vyberte TIFF, spusťte převod a stáhněte výsledný soubor. Nenahrávejte důvěrná data pacientů nebo výzkumná data, pokud příslušné požadavky na ochranu soukromí nepovolují externí zpracování.

Úvahy o kvalitě a kompatibilitě

Soubor LIF může obsahovat několik datových sad, takže převod může vytvořit jeden soubor TIFF pro každou sérii, kanál nebo časový bod namísto jednoho souboru reprezentujícího celou akvizici. Porovnejte výstup konvertoru s původním seznamem sérií.

Standardní TIFF může ukládat vícestránkové obrázky a stacky, ale mnoho aplikací, které nejsou určeny pro mikroskopii, zobrazí pouze první stránku. OME-TIFF je pro vícerozměrnou mikroskopii vhodnější, protože může zachovat strukturovaná metadata rozměrů a akvizice, ačkoli některé běžné editory obrázků tato metadata neinterpretují.

Pro kvantitativní měření, porovnávání intenzit a pozdější zpracování zachovejte 16-bitová data. Převod na 8-bitová data snižuje dostupný rozsah intenzit a nelze jej vrátit zpět. Po převodu ověřte velikost pixelu, z-step, časový interval, označení kanálů a kalibraci, protože export do TIFF může vynechat metadata specifická pro Leica, i když je viditelný obraz zachován.