Převod souboru CDX do PNG

Struktury ChemDraw se exportují do PNG, když systém pro rukopisy, prezentace, webová stránka nebo editor obrázků potřebuje standardní obrázek namísto upravitelného dokumentu .cdx. PNG také poskytuje neměnný vzhled pro sdílení chemických diagramů s příjemci, kteří nepoužívají ChemDraw.

Co soubory CDX obsahují

CDX je nejednoznačná přípona souboru. Nejčastěji označuje binární nativní formát ChemDraw a ChemOffice používaný pro chemické struktury, reakce, poznámky, popisky atomů, stereochemii a upravitelné rozvržení stránky. Tento zdrojový soubor si ponechte, protože zachovává chemické objekty a informace o kresbě, které PNG nedokáže uchovat.

Samostatný starší formát komprimované kresby CorelDRAW také používal příponu .cdx. Soubory ChemDraw CDX a CorelDRAW CDX nejsou vzájemně kompatibilní, proto před výběrem softwaru nebo online služby zjistěte, která aplikace soubor vytvořila.

Proč se používá PNG

PNG je bezztrátový rastrový formát podporovaný prohlížeči, kancelářským softwarem, publikačními systémy a editory obrázků. Podporuje průhlednost a zachovává tenké vazebné čáry, klínové šipky, horní indexy a text čistěji než JPEG, jehož ztrátová komprese může kolem liniové grafiky vytvářet viditelné artefakty.

PNG obsahuje pixely, nikoli upravitelné chemické struktury. Nezachovává konektivitu molekul, prohledávatelná data o strukturách, metadata reakcí ani upravitelné popisky.

Export souborů ChemDraw CDX

1. Otevřete soubor v ChemDraw pomocí File → Open.
2. Před exportem zkontrolujte zamýšlené konečné rozvržení. Opravte oříznuté popisky atomů, překrývající se objekty, hranice stránky a tloušťku vazebných čar při konečné velikosti zobrazení.
3. Použijte File → Export a vyberte PNG. Přesné znění nabídky a dostupné možnosti exportu se liší podle verze ChemDraw.
4. Nastavte požadované rozměry v pixelech. U tisku s předem známou fyzickou šířkou vypočítejte počet pixelů jako šířku v palcích vynásobenou požadovanou hodnotou ppi; 85 mm při 300 ppi odpovídá přibližně šířce 1 000 pixelů, zatímco 170 mm přibližně 2 000 pixelů.
5. Průhledné pozadí zvolte pouze tehdy, když je podporuje a vyžaduje cílová aplikace; pro předvídatelný vzhled v textových procesorech a tiskových pracovních postupech použijte bílé pozadí.
6. Otevřete exportovaný PNG ve 100% velikosti a zkontrolujte popisky atomů, náboje, stereochemické klínové šipky, šipky a malý text.

Hodnotu 300 ppi používejte jako běžný cíl pro tiskovou produkci, pokud ji požaduje vydavatel, ale rastrové detaily určují rozměry v pixelech; hodnota ppi uložená v PNG ovlivňuje především jeho výchozí fyzickou velikost v sázecím softwaru. Malý PNG po exportu nezvětšujte.

Další možnosti převodu

Pro automatizaci může Open Babel načíst mnoho souborů ChemDraw CDX a vytvořit jejich zobrazení ve formátu PNG, pokud nainstalovaná verze obsahuje podporu výstupu PNG/Cairo:

obabel input.cdx -O output.png --gen2d

--gen2d podle potřeby generuje dvourozměrné souřadnice. Open Babel nemusí přesně reprodukovat písma specifická pro ChemDraw, rozvržení stránky, reakční šipky ani složité poznámky, proto pro publikační grafiku použijte ChemDraw a porovnejte výstup s originálem.

CloudConvert a Zamzar nabízejí převod CDX na PNG v prohlížeči, ale ověřte, že služba identifikuje nahraný soubor jako soubor ChemDraw CDX, nikoli jako formát CorelDRAW. Nahrávejte pouze soubory bez důvěrných údajů; veřejné převodní služby nejsou vhodné pro nepublikované struktury, regulovaná data nebo materiály klientů, pokud jejich podmínky ochrany soukromí a uchovávání dat nesplňují požadavky příslušných zásad.

Starší soubor CorelDRAW CDX otevřete v kompatibilní verzi CorelDRAW nebo pomocí ověřeného staršího importéru a poté použijte File → Export k výběru formátu PNG a nastavení rozměrů v pixelech. Obecné editory obrázků obvykle žádnou z variant CDX přímo neotevřou.

Omezení kompatibility a kvality

PNG nelze bez překreslení nebo rozpoznání chemické struktury převést zpět na chemicky upravitelný soubor CDX. Nástroje pro rozpoznávání mohou nesprávně interpretovat popisky atomů, náboje, řády vazeb a stereochemii.

Ponechte si původní soubor .cdx a v případě, že vydavatel nebo tiskový pracovní postup přijímá vektorovou grafiku, exportujte také vektorový soubor PDF, SVG nebo EPS. Vektorový export lze zvětšovat bez rasterizace vazebných čar a textu, zatímco PNG je vhodný tam, kde je vyžadován neměnný bitmapový obrázek.