Převod souboru STK do PIV

Pochopení formátů souborů stk a piv

STK soubory jsou snímky zásobníků obrazu, které jsou běžně vytvářeny softwarem MetaMorph, používaným pro získávání a analýzu mikroskopických snímků. Tyto soubory obvykle ukládají sekvenci obrázků (například časově prodloužené nebo z-stack data) ve proprietárním formátu, často používaném v biologickém výzkumu.

PIV soubory jsou spojeny se softwarem Particle Image Velocimetry (PIV), který analyzuje tok tekutin sledováním pohybu částic mezi párami obrázků. Formát PIV se používá k ukládání buď surových obrazových dat, nebo zpracovaných polí rychlostních vektorů, v závislosti na softwaru.

Proč převádět stk na piv?

Převod STK na PIV je nutný, pokud chcete analyzovat sekvence mikroskopických snímků pomocí softwaru PIV za účelem studia dynamiky toku nebo pohybu částic. Jelikož PIV nástroje často vyžadují specifické vstupní formáty, převod zajišťuje kompatibilitu a přesnou analýzu.

Jak převést stk na piv

Přímý převod z STK na PIV není vždy jednoduchý, protože formáty slouží odlišným účelům. Typický pracovní tok zahrnuje extrakci snímků z zásobníku STK a jejich následný import do PIV analyzačního softwaru.

1. Extrahujte obrázky ze STK: Použijte ImageJ/Fiji, bezplatný a výkonný nástroj pro analýzu obrazu, k otevření souborů STK a exportu sekvence obrázků.
   File → Import → Image Sequence (pokud je třeba), poté File → Save As → TIFF nebo jiný podporovaný formát.
2. Importujte obrázky do PIV softwaru: Otevřete váš PIV analyzační nástroj (například PIVlab pro MATLAB nebo OpenPIV) a načtěte exportovanou sekvenci obrázků. Tyto nástroje obvykle přijímají standardní formáty obrázků (TIFF, PNG, BMP) pro analýzu.
3. Uložte nebo exportujte jako PIV: Po analýze vám software umožní uložit výsledky ve svém nativním formátu PIV.

Doporučený software pro převod stk na piv

• ImageJ/Fiji: Nejlepší pro extrakci obrázků ze souborů STK. Zdarma a široce používaný v vědecké vizualizaci.
• PIVlab (MATLAB toolbox): Oblíbený pro PIV analýzu a podporuje různé formáty obrázků.
• OpenPIV: Open-source nástroj pro PIV analýzu kompatibilní se standardními formáty obrázků.

Shrnutí

Pro převod STK na PIV extrahujte snímkové rámce ze souboru STK pomocí ImageJ/Fiji, poté je importujte do PIV softwaru jako PIVlab nebo OpenPIV. Tento pracovní tok zajišťuje kompatibilitu a přesnou analýzu toku.