Online konvertor ZVI do OME.TIFF zdarma
Převeďte mikroskopické snímky Zeiss ZVI na soubory OME-TIFF se zachováním metadat.
Převést ZVI na OME.TIFF online - zdarma
Váš soubor je zpracován okamžitě a není ukládán na naše servery.
Načíst soubor z adresy URL
Vložte přímý odkaz na soubor. Stáhneme ho na náš server a převedeme úplně stejně jako nahraný soubor.
Jak to funguje
-
1/3
Nahrajte soubor .zvi
Kliknutím vyberte soubor, který chcete převést, nebo ho jednoduše přetáhněte do vyznačené oblasti.
-
2/3
Spusťte převod .zvi do .ome.tiff
Po úspěšném nahrání souboru klikněte na převod, jakmile budete připraveni.
-
3/3
Stáhněte převedený soubor .ome.tiff
Výsledek převodu je připraven ke stažení.
Jak převést soubor zvi do formátu ome.tiff
- Grafika
- Dosud nehodnoceno.
101convert.com assistant bot
2 min.
Co je formát ZVI
ZVI (Zeiss Vision Image) je proprietární mikroskopický formát používaný starším akvizičním softwarem Carl Zeiss, zejména AxioVision a souvisejícími systémy. Soubor ZVI může v jednom souboru obsahovat obrazové roviny, časové body, kanály, ohniskové řezy, více sérií a metadata akvizice.
Se soubory ZVI se obvykle setkáte při přijímání dat ze starších mikroskopů Zeiss nebo z laboratoří, které používaly AxioVision. Formát je méně přenositelný než TIFF, protože jeho podpora závisí na specializovaných čtečkách, jako je Bio-Formats.
Co je formát OME-TIFF
OME-TIFF kombinuje obrazová data TIFF s metadaty OME-XML popisujícími rozměry, jako jsou kanály, Z řezy, časové body, velikosti pixelů a série obrazů. Je navržen pro vědecké zobrazování, nikoli pro běžné ploché fotografie.
OME-TIFF podporují Fiji, ImageJ s Bio-Formats, QuPath, napari prostřednictvím kompatibilních čteček a mnoho systémů pro správu výzkumných dat. Je vhodnou volbou, když si převedený soubor musí zachovat mikroskopické rozměry a metadata, místo aby se stal jediným zploštěným obrazem.
Jak skutečně převést ZVI na OME-TIFF
Pomocí Fiji
- Nainstalujte Fiji, které obsahuje importér a exportér Bio-Formats.
- Otevřete soubor prostřednictvím File → Open nebo Plugins → Bio-Formats → Bio-Formats Importer a poté vyberte
sample.zvi. - V dialogovém okně Bio-Formats Import Options ponechte povolenou možnost Display metadata, pokud potřebujete zkontrolovat zdroj, a vyberte požadovanou sérii. Použijte možnosti View stack with, které zachovají úplné rozměry Z, kanálů a času.
- Exportujte otevřený obraz prostřednictvím Plugins → Bio-Formats → Bio-Formats Exporter.
- Jako název výstupního souboru zvolte
sample.ome.tiff, pokud je zobrazena volba formátu, vyberte OME-TIFF a podle dostupnosti zvolte bezeztrátovou kompresi, například LZW.
Pokud Fiji otevře několik sérií, exportujte každou požadovanou sérii samostatně, když cílová aplikace neumí pracovat s vícesériovými soubory OME-TIFF. Původní soubor ZVI si ponechte jako archivní kopii.
Pomocí příkazového řádku Bio-Formats
Nástroj příkazového řádku Bio-Formats bfconvert může provést přímou konverzi:
bfconvert -compression LZW input.zvi output.ome.tiff
Použijte verzi Bio-Formats dodávanou s aktuální distribucí Fiji nebo Bio-Formats. U souborů obsahujících více sérií nejprve zkontrolujte vstup a v případě potřeby převeďte konkrétní sérii pomocí volby pro sérii odpovídající dané verzi. Přípona .ome.tiff vyžaduje výstup ve formátu OME-TIFF.
Pomocí online převaděče
Soubor můžete také zdarma převést na webu 101convert.com bez instalace softwaru. Tato možnost je praktická pro malý soubor, který neobsahuje citlivá data; nenahrávejte data pacientů, proprietární ani regulovaná mikroskopická data, pokud služba nesplňuje bezpečnostní požadavky vaší organizace.
Kvalita, kompatibilita a omezení
Bio-Formats obvykle přenese pixelová data a standardní rozměrová metadata, ale některá akviziční nastavení specifická pro Zeiss, proprietární anotace, předvolby zobrazení a metadata přístroje nemusí být do OME-XML převedena úplně. Po konverzi porovnejte počet kanálů, hloubku Z, časové body, rozměry pixelů a fyzické velikosti pixelů.
Použijte bezeztrátovou kompresi LZW nebo nekomprimovaný výstup, pokud musí numerické hodnoty pixelů zůstat nezměněné. Vyhněte se kompresi JPEG u kvantitativní mikroskopie, protože mění hodnoty pixelů. OME-TIFF může být větší než původní soubor ZVI, zejména při použití nekomprimovaných dat.
Velmi rozsáhlé datové sady mohou překročit limity klasického TIFF. Pokud to exportér nabízí a cílová aplikace podporuje, použijte BigTIFF. Před odstraněním nebo archivací zdroje ověřte, že cílový software rozpozná vygenerovaná metadata OME-XML a všechny zamýšlené série.
Poznámka: Tento záznam konverze zvi na ome.tiff je neúplný, musí být ověřen a může obsahovat nepřesnosti. Níže prosím hlasujte, zda pro vás byly tyto informace užitečné nebo ne.
Často kladené otázky
Je konvertor ZVI do OME.TIFF zdarma?
Ano, převod ZVI do OME.TIFF na 101convert.com je zcela zdarma. Není potřeba registrace, e-mail ani instalace. Pokud potřebujete vyšší limit velikosti souboru nebo chcete převádět více souborů najednou, podívejte se na naše tarify.
Jak velký může být můj soubor ZVI?
Můžete nahrát soubory ZVI o velikosti až 300 MB a převést až 3 souborů najednou v jedné dávce.
Co se stane s nahranými soubory?
Soubory se zpracovávají automaticky a několik minut po převodu jsou z našich serverů smazány. Vaše soubory nikdy neprohlížíme ani nesdílíme.
Musím pro převod ZVI do OME.TIFF instalovat nějaký software?
Ne. Převod ZVI do OME.TIFF probíhá kompletně online v prohlížeči a funguje na Windows, Macu, Linuxu, Androidu i iPhonu.
Konverze se nezdařila?
Ve většině případů je příčinou nesprávný formát souboru. Nahrajte platný soubor ZVI pro tuto konverzi z ZVI do OME.TIFF. Občas může být chyba také na naší straně. Analyzujeme opakované neúspěšné konverze, a pokud zjistíme závadu konvertoru, vypneme jej nebo opravíme.